Die Stifterfamilien Bouhon und Gierse sind die Initiatoren des Programms und engagieren sich maßgeblich in der Umsetzung. Die Stiftung Persönlichkeit trägt jährlich 120.000 € zur Finanzierung bei.
Die Stadt Nürnberg trägt jährlich 440.000 € zur Finanzierung bei und betreibt die Regiestelle MUBIKIN. Die externen, examinierten Musikpädagog*innen sind bei der Musikschule der Stadt Nürnberg angestellt.
Die Weiterbildung des Kindergarten-Personals und die musikpädagogische Fortbildung der Grundschullehrkräfte finden in der Hochschule für Musik Nürnberg statt. Die Fortbildungen werden von Doris Hamann und Michael Forster, Lehrende der Hochschule für Musik Nürnberg, Studiengang Elementare Musikpädagogik, geleitet.
Den Unterricht in Musikalischer Früherziehung, Musikalischer Grundausbildung sowie in den Chor- und Instrumentalklassen erteilen examinierte, bei der Musikschule Nürnberg angestellte Musikschullehrer*innen. Die Kinderkonzerte gehen auf ein künstlerisch-pädagogisches Konzept der Hochschule für Musik Nürnberg zurück. Studierende und Absolvent*innen der Hochschule führen die Konzerte auf.
MUBIKIN wird in den Schulen in Zusammenarbeit mit dem Staatlichen Schulamt in der Stadt Nürnberg umgesetzt.